В новой статье в EPJ Исторические перспективы современной физики, Даниэле Макулья из Пекинского университета в Пекине, Китай, Бенуа Ру из Чикагского университета в Чикаго, США, и Джованни Чиккотти из Римского университета в Риме, Италия, объясняют, как химик-теоретик Мартин Карплюс и его команда провели первое моделирование молекулярной динамики большой биологической молекулы, белок, оказавший глубокое влияние на биологию и физические науки в 20^th и 21^ул века. В настоящее время исследователи машинного обучения используют моделирование биомолекул, чтобы лучше понять их зависящие от времени движения и функцию, которая управляет взаимодействием между ними.

В начале 1970-х годов физики и физико-химики начали использовать моделирование молекулярной динамики для изучения поведения простых веществ, таких как вода и жидкости, образованные из благородных газов. Мартин Карплюс и его команда продвинули этот метод дальше, впервые применив его к большой биологической молекуле - белку.

Белки можно рассматривать как миниатюрные машины, функция которых частично обусловлена тем, как они сворачиваются и искажаются, принимая различные формы с течением времени. Из-за их сложности моделирование их изменений с течением времени было особой задачей. Карплюс впервые обнародовал этот подход в статье 1977 года, демонстрирующей первое молекулярно-динамическое моделирование белка. Совсем недавно глубокое влияние его вклада в точное моделирование химических реакций было признано присуждением Нобелевской премии по химии 2013 года вместе с Арье Уоршелом и Майклом Левиттом.

Авторы приходят к выводу, что статья Карплюса 1977 года открыла дверь для продолжения направления исследований, которое привело его к успешному объединению вычислительной статистической механики с биохимией.